Novos kits e novo fluxo de trabalho para plasma e proteômica de soro por LC

Capacitamos nossos clientes em ciências da vida para estabelecer conhecimento biológico por meio de soluções e fluxos de trabalho confiáveis ​​e eficientes que definem o padrão para análise de proteínas. Nosso espírito de equipe, energia e comprometimento...

HOUSTON, TX — Na ASMS 2023, a PreOmics GmbH anuncia o lançamento de seus novos kits ENRICH-iST™, que permitem o enriquecimento biologicamente imparcial de proteínas plasmáticas e séricas menos abundantes em partículas paramagnéticas não funcionalizadas, aumentando as profundidades típicas da análise proteômica plasmática em 50 por cento a mais de 100 por cento, em comparação com plasma puro ou proteômica sérica sem depleção ou enriquecimento. O novo fluxo de trabalho ENRICH-iST permite o processamento rápido e robusto de até 96 amostras de plasma em paralelo para pesquisa e validação translacionais e clínicas reprodutíveis de grande coorte. O fluxo de trabalho de enriquecimento de rotina ENRICH-iST acessível complementa bem os fluxos de trabalho de pesquisa de descoberta de proteômica de plasma ultraprofundo existentes que usam depleção automatizada de esferas ou enriquecimento de matriz de nanopartículas.

A tecnologia ENRICH-iST oferece uma solução simples, rápida (<5h no total) e econômica para o processamento de amostras proteômicas de plasma ou soro de várias espécies, incluindo humanos, roedores, NHPs, cães e porcos. Exigindo apenas 20 microL de material de partida, ele fornece consistentemente resultados melhorados e reprodutíveis para análise LC-MS, por exemplo, por espectrometria de massa DIA-PASEF timsTOF 4D Proteomics. Utilizando microesferas paramagnéticas não funcionalizadas, a tecnologia permite o enriquecimento biologicamente imparcial de proteínas menos abundantes e suporta plataformas de automação de manuseio de líquidos, como os sistemas Tecan FLUENT.

O Dr. Andreas-David Brunner, Drug Discovery Sciences, Boehringer Ingelheim Pharma GmbH & Co. KG, afirma: "Trabalhamos rotineiramente com coortes de biofluidos coletados de espécies pré-clínicas. dados sem desenvolvimento de método trabalhoso. O novo kit funcionou fora da caixa; o fluxo de trabalho é intuitivo e pode ser totalmente automatizado. Esta solução nos permite padronizar completamente nossos processos e melhora significativamente nosso rendimento."

Em um estudo de referência, amostras de plasma e soro de espécimes humanos, camundongos e ratos (dos fornecedores Sigma Aldrich, BioIVT e Diaserve Laboratories GmbH) foram processadas usando o novo fluxo de trabalho ENRICH-iST em comparação com a depleção baseada em anticorpos, bem como a amostras puras não processadas. Os peptídeos foram analisados ​​em um espectrômetro de massa timsTOF HT (Bruker Daltonics) no modo DIA-PASEF usando um gradiente nanoLC de 30 minutos. O fluxo de trabalho ENRICH-iST mostrou aumentar a profundidade proteômica de peptídeos e proteínas 1,5x – 2,2x -vezes em comparação com amostras puras. Os Coeficientes de Variação (CV) típicos nas réplicas ficaram abaixo de 12 por cento, enfatizando a alta repetibilidade do fluxo de trabalho do ENRICH-iST. A correspondência das proteínas identificadas com o banco de dados do proteoma do plasma revelou uma cobertura superior para o fluxo de trabalho do ENRICH-iST em relação a amostras limpas e depletadas com proteínas identificadas cobrindo uma faixa dinâmica maior. O ENRICH-iST apresentou maior precisão na faixa de abundância medida em comparação com o fluxo de trabalho de depleção.

A Dra. Catherine Nury, Gerente de Proteômica, Philip Morris International, Suíça, comenta: "Testamos várias opções para descoberta de biomarcadores em amostras de plasma, mas muitas eram demoradas e tediosas. Com a nova tecnologia ENRICH, temos uma solução rápida, eficiente e confiável fluxo de trabalho de enriquecimento para aprofundar o proteoma do plasma e soro humanos. Usamos os kits ENRICH-iST 96x e estamos encantados com a reprodutibilidade e facilidade do kit. Gostamos muito de trabalhar com a equipe PreOmics, que está sempre lá para nos apoiar . Recomendamos vivamente o kit a outros utilizadores de proteómica de plasma e soro."

A automação é a chave para a proteômica de plasma de alto rendimento e Luca Valeggia, vice-presidente sênior de automação de laboratório da Tecan, acrescenta: "Estamos muito satisfeitos em continuar nossa colaboração com a PreOmics. Ao automatizar seu novo kit ENRICH-iST em nossa estação de trabalho Fluent, 'estão permitindo uma preparação robusta e reprodutível de amostras de alto rendimento para grandes estudos de coorte, ajudando a acelerar ainda mais o progresso neste campo de rápido avanço."