Automação de coloração em todas as bancadas para imagens de tecidos melhores e mais reprodutíveis
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Automação de coloração em todas as bancadas para imagens de tecidos melhores e mais reprodutíveis

Apr 22, 2023

O Parhelia Omni-Stainer™ automatiza os protocolos de biologia espacial enquanto reduz os custos dos reagentes

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O microambiente tumoral é um conjunto complexo de células cancerígenas, células imunes, células estromais e componentes da matriz extracelular. As interações entre esses componentes podem afetar significativamente o crescimento do tumor e a resposta ao tratamento. Um certo avanço em nossa capacidade de mapear microambientes tumorais veio com o advento da era da biologia espacial, onde várias técnicas de imagem altamente multiplexadas são usadas para mapear dezenas de tipos de células in situ e algoritmos computacionais sofisticados são usados ​​para modelar quantitativamente suas relações no tumor contexto. Esses protocolos de várias etapas são muito caros, sujeitos a severas limitações de produção de amostras, propensos a variação de ensaio e são difíceis de adotar e padronizar em vários laboratórios.

A visão de Parhelia é inaugurar uma nova era de Biologia Reprodutível, na qual a conformidade, a reprodutibilidade e a robustez da pesquisa são alcançadas pela implementação de automação responsável no nível de uma bancada individual. Nesta visão, os protocolos serão compartilhados entre os laboratórios não por meio de treinamento individual e meticulosa engenharia reversa de tentativa e erro, mas sim pelo compartilhamento de scripts de automação de código aberto para download que podem ser implantados com o apertar de um botão. Forçar os pesquisadores a traduzir o conhecimento muitas vezes implícito de detalhes minuciosos de protocolos complexos em comandos robóticos exatos e explícitos permitirá uma rápida disseminação, fácil adoção, versão e validação independente de novos protocolos pela comunidade de pares.

Para ajudar a trazer esse futuro e enfrentar os crescentes desafios na pesquisa de biologia espacial, a Parhelia Biosciences criou o Omni-Stainer™, uma estação de trabalho de coloração de tecidos capaz de implantar continuamente uma infinidade de ensaios espaciais. Ao contrário dos volumosos autostainers de histologia do passado, o Parhelia Omni-Stainer™ é um dispositivo de bancada compacto com um preço intencionalmente bem dentro dos limites de orçamento CapEx de laboratórios de pesquisa de tamanho médio (<$ 15.000).

O Parhelia Omni-Stainer é um instrumento modular construído em um chassi de um manipulador de líquidos em formato SBS de código aberto. Os módulos são projetados para acomodar vários formatos de coloração de tecido, incluindo amostras regulares montadas em lâminas, bem como amostras mais exóticas montadas em lamínulas que são cada vez mais utilizadas em ensaios espaciais, como CODEX ou smRNA-FISH.

Cada módulo hospeda até 12 amostras em paralelo e o Omni-Stainer pode ser equipado com até 10 desses módulos, permitindo um rendimento máximo de 120 amostras por corrida. Os módulos Omni-Stainer podem ser equipados com blocos Peltier controlados programaticamente, permitindo um controle preciso da temperatura na faixa de 0-99C. Isso permite que ensaios com temperatura controlada sejam implantados no Parhelia Omni-Stainer, incluindo protocolos ISH, ligação e amplificação de DNA, IF cíclico e ensaios TSA, como Opal.

A coloração eficiente e uniforme da amostra é obtida por meio da troca de espaços capilares, que é o principal recurso do Omni-Stainer. As amostras são incubadas em uma fina camada capilar de 60um de líquido, o que reduz drasticamente o uso de reagentes caros, como conjugados DNA-anticorpo ou sondas FISH.

A flexibilidade incomparável do Parhelia Omni-Stainer permite a criação de protocolos complexos arbitrários por meio de uma API Python simples. Além disso, a Parhelia fornece aos usuários acesso ao StainWorks, um poderoso aplicativo da Web que contém um repositório compartilhado de protocolos validados e permite que os usuários modifiquem e executem esses protocolos sem precisar tocar em nenhum código. Atualmente, StainWorks contém protocolos validados para IF, IHC, CODEX (PhenoCycler), IMC, Opal e RNAScope, e a lista está em constante expansão.

O Parhelia Omni-Stainer já foi implantado nas principais instituições de pesquisa, incluindo Stanford, Harvard, Broad, MD Anderson, Mayo Clinic, WUSTL, bem como em P&D farmacêutico, incluindo Novartis e Genentech.